Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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NipblQ6KCD5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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