Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarca2Q6DIC0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms