Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms