Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pram1Q6BCL1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms