Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ino80dQ66JY2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ino80dQ66JY2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ino80dQ66JY2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ino80dQ66JY2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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