Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Col4a5Q63ZW6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Col4a5Q63ZW6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms