Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Klf3Q60980 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms