Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms