Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf123Q5XPI3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms