Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp18Q5SSI6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms