Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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