Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms