Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms