Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms