Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc33Q3ULW6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms