Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rnf149Q3U2C5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms