Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc174Q3U155 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms