Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hace1Q3U0D9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms