Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp8b1Q148W0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp8b1Q148W0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms