Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Itgb8Q0VBD0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms