Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Ttc21bQ0HA38 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttc21bQ0HA38 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms