Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Znf541Q0GGX2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms