Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp2Q08652 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms