Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Calb2Q08331 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Calb2Q08331 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms