Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Siah1bQ06985 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms