Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cab39Q06138 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cab39Q06138 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms