Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr5Q04683 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms