Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mc1rQ01727 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms