Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rbp4Q00724 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms