Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Shc1P98083 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms