Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx2P97474 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms