Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rps3aP97351 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms