Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tp53bp1P70399 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tp53bp1P70399 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tp53bp1P70399 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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