Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfixP70257 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfixP70257 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfixP70257 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms