Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Acta1P68134 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acta1P68134 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms