Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rad23aP54726 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rad23aP54726 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms