Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ercc3P49135 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms