Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rfx1P48377 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rfx1P48377 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx1P48377 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rfx1P48377 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rfx1P48377 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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