Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VhlP40338 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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