Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lig1P37913 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms