Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ptk2P34152 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ptk2P34152 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ptk2P34152 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ptk2P34152 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ptk2P34152 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ptk2P34152 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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