Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcdP28867 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms