Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RxraP28700 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RxraP28700 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RxraP28700 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RxraP28700 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms