Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkchP23298 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkchP23298 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms