Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Vpreb1P13372 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms