Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd4P10628 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd4P10628 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd4P10628 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Hoxd4P10628 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd4P10628 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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