Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms