Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PdgfrbP05622 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PdgfrbP05622 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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