Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mtnd1P03888 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mtnd1P03888 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mtnd1P03888 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mtnd1P03888 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mtnd1P03888 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mtnd1P03888 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mtnd1P03888 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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