Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms